SMP Unggulan Amanatul Ummah, program FDS (full-day school) menampung bahkan meneruskan siswa/i-nya yang sudah memiliki kompetensi awal dalam menghafal Al-Qur’an minimal Juz 'Amma atau sebagian besar surah dari Juz 'Amma itu untuk dimantapkan dan dikuatkan selama masa belajarnya di sekolah. Penerapan program ini juga didukung oleh ketersdiaan seorang Ustadz/ah pendamping khusus khotmil yang selalu memantau setiap hari perkembangan proses tahfidz siswa/wi pada saat sebelum pembelajaran formal dimulai. Proses dari pemberlakuan program ini menggunakan 3 tahapan, yaitu: Tartil (membaca), Tahfidz (Menghafal), dan Taqrir (Mengulang).